Аметист је троделни кристални систем, кристал је хексагонални стубасти, цилиндрична површина је попречна, постоје леви облик и десни облик, твин-кристал је врло чест.Тврдоћа је 7. Кристал често садржи неправилне или крилате гасно-течне инклузије.